法律分析：依據我國相關法律的規定，如果土地出讓合同是有約定土地使用人可以自建房屋的，在出讓的土地上自建房屋是不違法的。
《中華人民共和國城鎮國有土地使用權出讓和轉讓暫行條例》
第八條土地使用權出讓是指國家以土地所有者的身份將土地使用權在一定年限內讓與土地使用者，並由土地使用者向國家支付土地使用權出讓金的行爲。
土地使用權出讓應當簽訂出讓合同。
第十七條土地使用者應當按照土地使用權出讓合同的規定和城市規劃的要求，開發、利用、經營土地。
未按合同規定的期限和條件開發、利用土地的，市、縣人民政府土地管理部門應當予以糾正，並根據情節可以給予警告、罰款直至無償收回土地使用權的處罰。
第十八條土地使用者需要改變土地使用權出讓合同規定的土地用途的，應當徵得出讓方同意並經土地管理部門和城市規劃部門批准，依照本章的有關規定重新簽訂土地使用權出讓合同，調整土地使用權出讓金，並辦理登記。
農村自建房怎麼辦理土地證
土地證作用就是擁有該地塊的合法使用權，受法律的保護。土地證上會註明該土地的地理位置、用地性質、用地面積、使用者等相關資訊，農村自建房可以把土地使用權轉讓、作價出資、出租或抵押，辦理流程如下：
1、房屋轉讓連同土地使用權轉移，需提交房屋買賣協議、房照、原土地使用證。
2、房屋連同土地使用權繼承，贈與需提交房照、原土地使用證、公證書或使用權人親筆簽名協議與街道證明。
3、新建房屋土地登記需提交土地和規劃部門建房批件。
4、農村自建房土地證書遺失或者損毀的，土地權利人應當及時向原發證機關備案，申請補發新證，在當地報紙上進行公告。自公告之日起三十日內無異議的，原發證機關注銷原土地證書，補發新證書。
5、買賣分宗、繼承、贈與分宗須雙方共同到局辦理。
6、委託代辦除提交上述資料外，還須提供委託人簽名蓋章的委託書。
法律依據：《中華人民共和國城鎮國有土地使用權出讓和轉讓暫行條例》
第八條土地使用權出讓是指國家以土地所有者的身份將土地使用權在一定年限內讓與土地使用者，並由土地使用者向國家支付土地使用權出讓金的行爲。
土地使用權出讓應當簽訂出讓合同。
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