三五九旅在南泥灣實行了“剿匪聯保”政策,具體包括:開闢“綠色通道”,協助農民避免抗稅;組織安民委員會,在當地設立村莊和警務站;加強肅反斗爭,公開審判鄉紳惡霸和匪首惡煞,打擊土匪惡勢力。此外還開展了“治理水利,興修魚塘”的勞動積極性運動,以鼓勵農民發展漁業和拓展經濟,穩定當地社會局勢。