1、性質不同:衛健委即國家衛生健康委員會是國務院組成部門,爲正部級。衛生局是地方各級醫院的主管部門。
2、職責不同:衛健委貫徹落實黨中央關於衛生健康工作的方針政策和決策部署,在履行職責過程中堅持和加強黨對衛生健康工作的集中統一領導。