港澳通行證簽註規定了港澳通行證前往的地方(香港或者澳門)和次數。申請港澳通行證、填寫申請表格時有一項選擇是讓您選擇您所要前往的目的地,您可以選擇香港或者澳門,同時簽註還有次數的選擇,一般簽註會註明您可以前往的次數,目前辦理的通行證的來往次數都是2次的。次數用完了是可以續簽的。
赴港澳的簽註種類共分4種:
L簽註(即團隊旅遊簽註,必須隨旅行團進出);
G簽註(即個人旅遊簽註,不受跟團旅遊限制,可赴港澳自由行);
S簽註(即商務簽註);
T簽註(即探親簽註)。